ドナーの腸内細菌で、しつこい腸の感染症の81%が治った

執筆：David Beckwith

エビデンス・チェック、2026年10月12日。2026年10月31日更新。

説：「健康な人の腸内細菌を移植すると、抗生物質のあとに再発をくり返す腸の感染症が治る。」

私たちの評価：確か。 ランダム化試験で、ドナーの腸内細菌は再発性の C. difficile 感染症の患者の81%を治しました。標準の抗生物質では31%でした。腸内細菌からつくった製品2つが、今では FDA に承認されています。証明されているのはこの一つの感染症についてで、ほかの腸の説は下で順位づけしています。

レオは26歳。SNS のフィードには、腸内細菌が気分も睡眠も食欲も体重も左右している、という話があふれています。ネットのカートには腸内フローラ検査のキットが入っていて、その横にはプロバイオティクスがあります。

腸内細菌を変えて、何かの病気が治ったことはあるのでしょうか。

あります。しかもあるケースでは、効果が大きすぎて試験が途中で打ち切られました。2013年、オランダの医師たちが、再発をくり返す腸の感染症の患者16人に健康なドナーの腸内細菌を入れたところ、13人（81%）が治りました。標準の抗生物質で治ったのは13人中4人（31%）でした [8]。

その結果は、今では承認された治療になっています。そしてこれは、腸の中の細菌が病気か健康かを左右しうることを示す、今ある最も良い証拠でもあります。

この説の出どころ

C. difficile は、ひどい下痢を起こす細菌です。ほかの病気のために飲んだ抗生物質が腸のふだんの細菌を一掃したあとに、住みつくことがよくあります。2017年、米国の入院患者では推定22万3,900件の感染と1万2,800人の死亡がありました [48]。

ふつうの治療は、別の抗生物質です。C. difficile は殺せますが、ふだんの細菌を呼び戻すことはできないので、薬をやめると感染がぶり返すことがあります。ある試験では、抗生物質だけで治療した人の40%で、8週間以内に再発しました [9]。

そこで医師たちは逆のことを試しました。健康な人の便を使って、失われた細菌を戻すのです。

腸内細菌は消化よりはるかに多くのことを左右している、というもっと広い考えは、多くの人にポッドキャストを通じて届きました。2022年2月、アンドリュー・ヒューバーマンはリスナーに「腸内細菌が育つ正しい環境をつくることは、本当に気分と幸福感を高めます」と話しました [6]。1週間後、スタンフォード大学の微生物学者ジャスティン・ソネンバーグとの回では、こうした微生物は「私たちの健康、つまりホルモンの健康、脳の健康、免疫の働きにとって、計り知れないほど有益になりうる」と述べました [7]。限界についても公平でした。気分についての発言と同じ文の中で、研究は「主に動物モデル、たいていはマウスで行われた」と話しています [6]。

ドナーの細菌で患者の81%が治った：確か

オランダの試験では、再発性 C. difficile の患者42人を3つのグループにランダムに分けました。一つのグループは健康なドナーの便を、管を通して小腸の上部に入れてもらいました。ほかの2つのグループは標準の抗生物質バンコマイシンを、腸の洗浄ありか、なしで受けました [8]。

1回の注入で、16人中13人（81%）が治りました。治らなかった3人は別のドナーから2回目の注入を受け、うち2人が治りました。合わせて16人中15人（94%）です。

バンコマイシンだけでは13人中4人（31%）、バンコマイシンと腸の洗浄では13人中3人（23%）が治りました。試験は、途中で結果を確認した段階で打ち切られました [8]。

副作用は、注入した日の軽い下痢と腹痛でした。その後、患者の腸内細菌はドナーと同じくらい多様になっていました [8]。

今では承認された治療に：確か

管と新鮮なドナーを誰にでも用意するのは難しいので、企業はこの考えを製品にしました。

2022年11月、FDA は最初の製品を承認しました。ドナーの細菌を肛門から1回入れるものです。プラセボ対照の2つの試験を分析すると、8週間感染が出なかった人は推定70.6%、プラセボでは57.5%でした [49]。

次に出てきたのがカプセルです。182人の試験で、精製した腸内細菌を口から飲むと、感染の再発率が40%から12%に下がりました [9]。2023年4月、FDA はこれを口から飲む初めての腸内細菌製品として承認しました [10]。この試験の費用はメーカーが出しています。

ここから大事なことがわかります。細菌の集まりが失われると重い病気になることがあり、それを戻すと治ることがあるのです。

次の舞台：がんの薬を効きやすくする：有望

ここが最も希望のある最前線です。がんの免疫の薬は、効く患者と効かない患者がいて、腸内細菌がその理由の一部のようなのです。

比較グループのない3つの小規模な研究で、進行したメラノーマの患者45人が免疫の薬と一緒にドナーの腸内細菌を受け、22人に効果が出ました。中には、それまで治療が効かなくなっていた人も含まれます [42, 43, 44]。そして2026年、公正な試験が行われました。イタリアの研究者たちが、腎臓がんの患者45人を、標準の薬に加えてドナーの細菌かプラセボを受けるグループにランダムに分けたのです。がんが抑えられた期間の中央値は、ドナーの細菌で24.0か月、プラセボで9.0か月でした [45]。試験の主な物差し、つまり1年の時点でがんが大きくなっていない患者の割合は70%対41%で、偶然を否定する基準にわずかに届きませんでした。

自分でできること：発酵食品で炎症が下がる：有望

腸内細菌を変えるのに、ドナーはいりません。食べ物で数週間のうちに変わりますし、これまでで最も良い試験では、ある種類の食べ物が目立った結果を出しました。

スタンフォード大学の研究者たちは、健康な成人36人に、発酵食品か食物繊維のどちらかを増やして10週間食べてもらいました [11]。発酵食品のグループは、1日0.4品目から6.3品目に増えました。腸内細菌の多様性は着実に上がり、血液中の93種類の炎症マーカーのうち19種類が下がりました。長く続く炎症で上がる IL-6 というマーカーもその一つです。

食物繊維のグループは、食物繊維を1日21.5g から45.1g へと2倍に増やしました。10週間では細菌の多様性は変わりませんでしたが、細菌が食物繊維を分解する酵素を多くつくるようになっていました。

だからといって、食物繊維が無駄というわけではありません。185件の長期研究をまとめた Lancet のレビューでは、食物繊維を最も多く食べていた人は死亡率が15～30%低く、最も効果が大きかったのは1日25～29g でした [12]。これらの研究では誰も腸内細菌を測っていないので、細菌が理由だとは言えません。

逆向きの関係もあります。食べ物から何が得られるかを、細菌が決めているのです。ザクロやクルミには、筋肉や心臓の健康のために売られているウロリチン A という成分は入っていません。腸内細菌がそれらの食べ物からつくるのですが、約10人に1人はまったくつくれません [46]。成人100人がザクロジュースを飲んだところ、翌日の血液中に意味のある量があったのは約40%だけでした [47]。詳しくはウロリチン A のエビデンス・チェックをご覧ください。

スタンフォードの試験には限界がありました。小規模で、ふだんどおりに食べるグループがなく、試験が確かめようとしていた結果（免疫の総合スコア）はどちらのグループでも変わりませんでした。炎症マーカーの低下は副次的な結果です [11]。食物繊維の数字の多くは、人がふだん食べているものを観察する研究から来ており、それに加えて、体重やコレステロールなどを測った成人4,635人の試験58件があります [12]。

抗生物質は跡を残します。健康な男性12人が強い抗生物質3種類を4日間飲みました。腸内細菌はおおむね1.5か月以内に戻りましたが、よくある9種類の細菌は、180日後もほとんどの人で欠けたままでした [13]。健康なボランティアを対象にしたイスラエルの小規模な研究では、抗生物質のあとにプロバイオティクスを飲むと、何も飲まない場合に比べて自分の細菌が戻るのが遅れました。健康への影響は測られていません [14]。必要なときは抗生物質を飲みましょう。これは、必要ないときには飲まない理由です。

自宅でできる便の検査は、まだ使える段階ではありません。米国の標準化機関 NIST の科学者たちが、1つの便のサンプルを均一になるまで混ぜ、7つの検査会社に3キットずつ送りました。報告された細菌の種類は34から906までばらばらで、すべての報告に出てきたのは3種類だけでした。ある会社は同じサンプルを2回は健康、1回は不健康と判定しました。7社のうち3社は C. difficile がいると言い、4社はいないと言いました [15]。18か国の専門家69人による委員会は、「臨床でマイクロバイオーム検査を日常的に使うことを広く勧めるには、証拠が不十分」と結論づけています [16]。

限界：一つの感染症だけ、検査済みのドナーだけ

証明されているのは一つの感染症についてです。承認された2つの製品はどちらも、C. difficile がすでに再発した大人が、抗生物質のあとの次の再発を防ぐためのものです [10, 49]。

最初の試験は42人と小規模で、参加者は全員、自分がどの治療を受けているか知っていました [8]。カプセルの試験は、メーカーが費用を出していました [9]。最初に承認された製品の差はもっと小さく、70.6%対57.5%でした [49]。

ドナーの便は、助けにもなれば害にもなります。2019年、免疫の弱い2人が、同じドナーの便からつくった移植で薬の効かない大腸菌に感染しました。その便は、この菌の検査をしていませんでした。1人が亡くなっています [50]。その後、FDA はドナーの便にこうした菌の検査を義務づけ、承認された製品は検査済みのドナーから来ています。それでも FDA は、人の便からつくった製品には感染を移すリスクがありうると述べています [49]。

だからこそ、移植は医師が行うもので、決して自宅で試すものではありません。

ほかの腸の説の順位

一つの感染症が治るからといって、レオのフィードに流れてくるほかの話が証明されたことにはなりません。ここでは腸についての10の説を、人での根拠の良さの順に、良いものから並べます。

最初の3つは上で取り上げました。残りは以下のとおりです。

その背景にある動物の研究は本物で、目を見張るものです。細菌をまったくもたずに育てたマウスに、肥満の人の双子の腸内細菌を入れると、やせた双子の細菌を入れたマウスより脂肪が多くつきました [32]。それぞれの説で問われるのは、人でも同じことが起きるかどうかです。

気分：有望

気分は試験の数が最も多く、結果は良い方向に傾いています。2025年のレビューは、プロバイオティクスやそれに近いサプリメントのランダム化試験72件をまとめました。うつのスコアはプラセボと比べて中程度に下がりましたが、著者たちは「ばらつきが大きく、方法論の質が限られている」と注意しています。つまり、試験どうしの結果が食い違い、質の弱い試験も多かったということです [17]。

個々の試験は両方向を指しています。ロンドンでは、抗うつ薬を飲んでいる49人がプロバイオティクスかプラセボを8週間追加しました。予備的な試験で、プロバイオティクスのグループのほうが、うつのスコアが低くなって終わりました（8.83対11.09）[18]。スウェーデンの75人の試験では、どの指標にも効果はありませんでした [19]。2026年の中国の試験では、うつ病の60人が、いつもの薬に加えてドナーの腸内細菌のカプセルかプラセボを飲みました。2週間の時点で、移植のグループの30%に効果が出ました（プラセボは6.7%）。8週間の時点で寛解していたのは43.3%対26.7%でしたが、この差は偶然の可能性があり、試験は主な目標を達成できませんでした。費用の一部はカプセルのメーカーが出しています [20]。こうした研究の背景には、ベルギーの1,054人の研究があり、うつ病の人では2つのグループの腸内細菌が少なくなっていました [21]。これは関連を示すもので、どちらが先かはわかりません。

睡眠：弱い

14件の試験をまとめたレビューでは、プロバイオティクスを飲んだ人は、21点満点の質問票で自分の睡眠を0.78点良く評価しました。機器で測った睡眠は変わりませんでした [22]。

元気：弱い

慢性疲労症候群の人（患者106人、健康な人91人と比較）では、腸の内側の壁の燃料になる酪酸をつくる細菌が少なくなっていました [23]。ところが、患者11人での移植の試験では「症状は和らがなかった」のです [24]。最も良い知らせは香港からです。新型コロナ後遺症の463人が、細菌と食物繊維を組み合わせたものかプラセボを6か月飲んだところ、疲れが軽くなる見込みは組み合わせのほうで約2倍でした [25]。一つの病気での一つの試験なので、再現が必要です。有名な「マラソンランナーの細菌」の研究は、ランナー15人からある微生物を見つけましたが、運動能力のテストはマウス32匹で行われ、マウスが13%長く走ったというものでした [26]。

ホルモン：弱い

51人の研究では、腸内細菌の多様性が高い人ほど、男性と閉経後の女性ではエストロゲンの値が高くなっていました。若い女性では両者に関係はありませんでした [27]。46件の試験、3,516人をまとめた分析では、プロバイオティクスでストレスホルモンのコルチゾールが少し下がりましたが、確かさは低いと評価されています [28]。テストステロンについては、関連を観察した研究しかありません。

食欲：未証明

細菌が食べたいものを操っているという考えは、データのない2014年の仮説の論文から始まりました [29]。異なる腸内細菌を入れたマウスは、実際に違う食べ物を選びました [30]。腸内細菌を変えて食欲を測った人での試験はありません。一番近いのは、細菌が食物繊維からつくる物質を試したものです。太り気味の成人60人が1日10g を24週間とったところ、体重の増え方が小さくなりました [31]。

移植による減量：否定済み

3つのランダム化試験で、肥満の人にやせたドナーの腸内細菌を入れました。成人22人、成人24人、十代87人です [33, 34, 35]。誰も体重は減りませんでした。9件の試験、303人をまとめた分析でも、体重に差はありませんでした [36]。もっと良さそうな新しいアイデアが一つあります。ダイエットを終えたばかりの成人90人の2026年の試験で、加熱処理したアッカーマンシア（Akkermansia）という細菌を毎日とると、24週間のリバウンドが1.2kg（2.6ポンド）に抑えられました。プラセボでは3.2kg（7.1ポンド）でした [37]。

血糖：弱い

男性を対象にしたオランダの小規模な試験2件で、やせたドナーの細菌は6週間後にインスリンへの体の反応を良くしました。ただ、大きいほうの38人の試験では、18週間までに効果は消えていました [38, 39]。アッカーマンシアは、32人が最後まで参加した試験でインスリンへの反応を約29%良くしましたが [40]、2型糖尿病の58人では全体として効果はありませんでした [41]。

まだまだ発見が続く理由

現代の基準で地図がつくられている海底は、全体の28.7%だけです [1]。腸もそんな場所です。腸には約38兆個の細菌がいて、自分の体の細胞とほぼ同じ数で、合わせて約0.2kg（半ポンド）になります [2]。人の遺伝子は2万個足らずです [4]。1,267人の腸内細菌からつくったカタログでは、990万個の遺伝子が見つかりました [3]。今記録されている腸の細菌4,644種のうち、70%以上は実験室で培養されたことがなく、そのたんぱく質の40%は、何をしているのかまだ誰にも説明できません [5]。

つまり、これはまだ初期の地図で、最初にきちんと描けた海岸線の一部が、ある病気の治療だったのです。

レオの話に戻りましょう。腸内細菌を変えて病気が治ったことは、あります。試験を途中で打ち切るほどはっきりした結果でした。彼にとって、その話のうち今日から使える部分は、キムチの瓶と豆です。便の検査は後回しでかまいません。

私たちの評価

気分、睡眠、元気、ホルモン、食欲、体重、血糖の評価は、上の順位表にあります。

反対側の言い分：最初の試験は42人で盲検化もされておらず、早期に打ち切られた試験は、その後の試験より効果を大きく見せる傾向があります。

2つの製品の試験はメーカーが行ったもので、一方の差はもう一方よりずっと小さなものでした。

そして、一つの病気が治るからといって、ほかの病気にも当てはまるわけではありません。同じ移植で、3つの試験で体重は減りませんでした。

評価が変わる条件：大規模で独立した試験で効果がなければ、評価は下がります。がんについて、主な目標を達成する2件目のランダム化試験が出れば、その行は「確か」に上がります。

あなたにとっての意味

• 抗生物質のあとに C. difficile が再発したなら、承認された腸内細菌の治療について医師に相談しましょう。移植を自宅で試すのはやめてください。ドナーの便は検査が必要です [50]。
• 発酵食品を毎日食べましょう。試験では、ヨーグルト、ケフィア、キムチ、ザワークラウト、コンブチャを、4週間かけて1日約6品目まで増やしました [11]。生きた菌が入った、冷蔵で売られているものを選びましょう。免疫が弱い人は、先に医師に相談してください。
• 食物繊維を1日25～29g、豆、オーツ麦、野菜、果物、ナッツからとりましょう [12]。食物繊維の根拠については、5つの健康習慣の記事で取り上げています。
• 抗生物質は必要なときだけ飲み、飲むときは最後まで飲み切りましょう。一部の腸の細菌は180日後も戻っていませんでした [13]。
• 自宅でできる便の検査は見送りましょう。同じサンプルでも、報告の内容は大きく違いました [15]。
• うつ病があるなら、プロバイオティクスは治療に加えるものとしてはリスクが低い一方、治療の代わりにするには不十分です [17, 19]。
• 腸内細菌によって、食べ物から得られるものが変わることも知っておきましょう。ザクロからウロリチン A が得られるかどうかも、細菌が決めています。

今後の展望

がんの免疫の薬とドナーの細菌を組み合わせた、より大規模な試験が進んでいて、注目すべきはそこです。報告が出たら、このページを更新します。

このシリーズの次の記事：抗生物質を飲んでいる間に、砂糖が腸内細菌に何をするかについての新しい研究。その次は、発酵食品と自宅でできる便の検査をそれぞれ単独で取り上げます。

サプリメントが血液の数値を変えても、体の感じ方は変わらなかった例については、NAD ブースターをご覧ください。

参考文献